Ordens organisation
Det högsta beslutande organet är den årligen sammankallade Riddardagen som normalt äger rum i maj. Samtliga medlemmar äger plats och stämma i Riddardagen.
Johanniterordens i Sverige leds av en styrelse (konvent), vars ordförande kallas kommendator. Konventets ledamöter har särskilda operativa uppgifter. En kansler ansvarar för Ordens administration. En intendent ansvarar för hjälpverksamheten. Andra åter arbetar med ekonomi, finansiella frågor, juridiska spörsmål och ceremoniell. F.n. består konventet av tio ledamöter.

Ordens ledning strävar efter att engagera så många som möjligt av medlemmarna i Ordens verksamhet. För varje hjälpprojekt tillsätts t.ex. en kontaktperson.
Orden har två grader: riddare och rättsriddare. Orden kan kalla förtjänta personer som hedersledamöter.
Orden har etablerat fyra regionala representationer för att nå ut med stöd och hjälp i hela landet.
Kung Carl XVI Gustaf är Ordens höge beskyddare.

Orden har sitt säte på Riddarhuset samt sitt kansli på Rigagatan 12 i Stockholm.

Postadress: Box 24 172, 104 51 Stockholm.
Tel: 08 664 40 20
Epost: kansli@johanniterorden.se

Plusgiro: 5 25 52-7
Bankgiro: 612-8144

Obs
Inom och utom Sverige finns organisationer som orättmätigt kallar sig johanniter och malteser. Dessa har självfallet varken att göra med den suveräna Malteserorden, eller de ordnar som ingår i Johanniteralliansen.

Medlemmar
Johanniterorden i Sverige har cirka 360 medlemmar. Av dessa är 60 rättsriddare. Ordens medlemmar utnämns av kommendatorn efter enhälligt förslag av Ordens konvent. Det är med annat ord ej möjligt att ansöka om medlemskap.
Orden begär av sina medlemmar, att de skall vara dels kristna (protestanter), dels svenska medborgare. De skall efter bästa förmåga främja Ordens verksamhet och intressen.
Riddarna bär bröst- och halskors utformade som vita emaljerade s.k. malteserkors. Halskorset, som bärs i svart vattrat sidenband med smala vita kanter, har i vinklarna en vase i guld och är för rättsriddare krönt med en kunglig krona i guld. Johanniterorden i Sverige är en s.k. halvofficiell orden vilket bl.a. innebär att Ordens tecken kan bäras även vid andra tillfällen än sådana som berör Ordens verksamhet.